网络热点新闻

大同百姓网:‘把资料’储存『到』DNA里,是拯救数据激增的的良方?

来源:申博官方网 发布时间:2020-05-07 浏览次数:

DNA能不能当做硬碟来储存数据讯息呢?谜底是,可以的。DNA绝对是这个星球上最古老的生命讯息储存工具,同样也可以作为数据讯{息的储存介质},且储存密度和使用寿命要远远超泛起有的磁盘式的储存方案。因此,DNA储存,正在被人类视为数据储存的未来,成为拯救人类数据储存危急的最好的替换方案。

 加入T客邦telegram送《任天堂Switch大补丸》 ( https://bit.ly/35gy8ig )  

开一个脑洞:若是地球正在面临一场马上到来的毁灭性星际灾难,人类又想尽可能地保留地球的生命和文明,在现有条件下,该怎么办?

让地球住手自转然后逃离太阳系?这生怕来不及了。而若是像诺亚方舟一样,一股脑把人类、动植物和人类的知识搬运到飞船上,现有的火箭运载能力,生怕也装不下这些物质的亿万分之一。

若是想尽可能多、尽可能恒久地保留地球的生物,我们只需要把所有物种的DNA序列讯息网络打包,在飞船的低温环境下便可以保留长达数十万年;而人类文明的讯息呢?我们知道这些讯息最高〖效的形式就是数〗据,而这些数据主要储存在硬碟和光碟当中的。

想想这些硬碟储存器的重量和数据密度,我们不得不再一次气馁。更何况,可能飞船还没逃出太阳系,这些数据就会由于硬碟或光碟的寿终正寝而丢失。

那么DNA能不能当做硬碟来储存数据讯息呢?谜底是,可以的。

DNA绝对是这个星球上最古老的生命讯息储存工具,同样也可以作为数据讯{息的储存介质},且储存密度和使用寿命要远远超泛起有的磁盘式的储存方案。因此,DNA储存,正在被人类视为数据储存的未来,成为拯救人类数据储存危急的最好的替换方案。

DNA储存详细是怎么做到的呢?现在生长到那一阶段?【商用的话还】有哪些阻碍?这需要我们逐一解答。

DNA储存是若何事情的?

在领会DNA储存是若何事情的之前,我们简朴领会下磁储存和光储存这两种现有的解决方案的原理。

磁储存的原理就是在金属材料上涂上磁性介质,在通电的情形下形成电磁效应,可以举行储存和表达0101的二进制讯息。磁储存的硬碟的优点是存入和读取的速率(快),瑕玷是与体积重量相比,数据密度较低。经由60年生长,也许可以在3.5英吋巨细的硬碟驱动上储存3TB数据。

光储存的原理是将数位编码的影片和音讯储刻录在光碟外面的凹槽中,再透过雷射将这些凹槽中的数据读取出来,举行转存或播放。当前,光储存也正在履历储存的极限。由于想要存下更多的数据,凹槽就必须越小、越紧凑,要求雷射的精度也越高。〖现在〗,单层蓝光光碟能够保留 25GB 以上的讯息,另一种紫外线雷射若是研制乐成,其光碟容量可以到达500GB的容量。

相对于磁储存和光储存而言,DNA储存有哪些优势?

首先,就是节约空间。但这些单层平铺式的储存方式,比起DNA的双螺旋立体结构来说,其储存量就有了多个数量级的差距。DAN自己的物理体积极小且又是立体结构,单元空间的数据密度异常高。举个简朴的例子,1克DNA不到指尖上一滴露珠巨细,却能够储存700TB的数据,相当于1.4万张50GB容量的蓝光光碟,或233个3TB的硬碟(差不多151公斤重)。

再则,异常节能。现有储存方式,好比说一个数据中央,要消耗大量的单晶矽,还要消耗大量的电。而DNA物质只需保留在阴凉、干燥的地方就可以,基本不需要分外的人工维护。就算需要把DNA冷冻起来,消耗的资源和能源也险些可以忽略不计。

此外,最主要的一点就是,保留时间异常久。现在高密度的储存器都市随着时间推移而衰减,能储存时间最长的工具是磁带,其寿命也就50年,其他的储存装置寿命更短。比较而言,DNA则保质期就以百年计算了,若是将其冷冻起来,能保留几千甚至上万年。

看来人类文明的拯救方案有了,但DNA储存到底是若何做到的呢?

众所周知,DNA由四种含氮碱基——A、T、C和G‘互补配对组成’,科学家将腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和胸腺嘧啶(T)划分赋予二进制值(A和C=0 ,G和T=1),随后通过微流体晶片对基因序列举行合成,从而使该序列的位置与相关数据集相匹配。这样就把这些碱基对编码成1和0的组合,就可以用DNA的序列讯息来表达二进制的语言了。

当每次将二进制语言写进DNA序列当中,就可以把「DNA硬碟」放到低温环境中举行保留。而需要读取数据的时刻,只用对目的DNA举行测序,将碱基对还原成二进制编码,再完成解码,就可以还原为我们常见的数据了。

原理是异常简朴,但科学家是若何做到的呢?这就要简朴回首下DNA储存手艺的生长史了。

DNA『储存是若何一步步生长』到现在的?

最先想到这一方式的是一位艺术家Joe Davis,他在1988年与哈佛研究人员互助,把一个取名为Microvenus(小维纳斯)的7*5像素矩阵的照片,转化成35个碱基的DNA序列,插入到大肠杆菌里,第一次把不属于自然演化的讯息写进了在DNA当中。Microvenus代表女性和地球

2010年,美国合成生物学家克雷格·文特尔((Craig Venter)率领研究团队化学合成了整个支原体基因组DNA,取名为「辛西娅(Synthia)」,并以「自娱自乐」的方式将课题研究者的名字、〖研究所网址〗和爱尔兰诗人詹姆斯的诗句等讯息编码进新合成的DNA中。

2011年,哈佛大学的合成生物学家乔治‧丘奇(George Church)和加州大学的瑟里‧库苏里(Sriram Kosuri)向导的团队以及约翰·霍普金斯大学的基因组专家高原(Yuan Gao)首次举行了观点证实性【实验】。团队使用短DNA片断编码了一本丘奇的659KB数据的书。

2013年,欧洲生物讯息研究所(EBI){的尼克}·高德曼(Nick Goldman)和他的研究团队也乐成地将包罗莎士比亚十四行诗和马丁·路德·金「我有一个梦想」的演讲片断、一篇沃森和克里克DNA双螺旋论文副本等5个文件编写进了DNA片断里当中。739KB数据成为那时最大的DNA储存文件。

2016年,微软和华盛顿大学又行使DNA储存手艺完成了约200MB数据的储存,成为DNA讯息储存手艺的一个飞跃。

2017年7月,《自然》杂志揭晓了哈佛大学医学院的赛斯·希普曼(Seth Shipman)和乔治‧丘奇互助的一项活体DNA储存的研究。他们把一部130年前的是非影戏《奔跑中的马》存在了大肠杆菌的DNA上。虽然大肠杆菌体内有一段「新鲜的DNA」,不仅能够正常生计,还可以正常遗传,每次繁衍都是一次数据复制。而且储存在基因组中的影戏,在每一代大肠杆菌中也都完整无缺地保留下来了。

但由于细胞的复制、盘据以及殒命,会造成讯息失足的风险,未来数据平安,大多数情形下储存讯息的DNA都是以DNA干粉的形式存在,活体细胞储存的研究转向合成DNA储存。

统一年,哥伦比亚大学和纽约基因组中央在《科学》杂志揭晓了一项称为「DNA喷泉」演算法高效的DNA储存计谋。这项手艺展示了最大化行使DNA的储存潜力,乐成将巨量讯息压缩至DNA的四个碱基,即为每个DNA编码1.6比特(bits)的数据,比之前多储存了60%的讯息,迫近理论极限(1.8比特)。该方式能够将215PB数据储存在一克DNA中,相当于2.2亿部影戏。

2018年,爱尔兰沃特福德理工学院(WIT)研究人员开发出一种新型DNA储存方式,可在1克大肠杆菌DNA中储存1ZB的数据。

2019年,丘奇团队又在《科学》期刊上揭晓了一项【实验】效果。他们将丘奇的一本约莫5.34万个单词《再生:合成生物学将若何改变未来的自然和自己》的书,以及11张图片和一段Java程序,编码进不到亿万分之一克的DNA微晶片,再乐成行使 DNA 测序来阅读这本书。

向成熟。但同时,DNA编码历程仍然存在着储存/读取速率和成本等问题,DNA储存离商业化还在路上。

DNA储存商业化的问题与希望

在【实验】室里,看起来DNA储存并不庞大,但是在商业化上面,仍然还面临着一些问题。

首先,储存和读取的速率都很慢。DNA储存装备的存取速率很慢,存取也很费时间。相比较磁盘储存的电磁“信号”,DNA合成却要依赖于一系列化学反应。用磁盘写入200MB数据,不用1秒,用DNA合成差不多得需要3周的时间。

其次,DNA介质不能覆蓋和重写。在DNA里,一旦把讯息存进去,一般来说不能修改。想读取这个文档,需要把所有讯息完全测序出来再转码。

第三,数据储存的准确性有待提高。〖现在〗DNA测序时的重复读取导致读错概率较大。

第四,随机读写难题。〖现在〗DNA合成手艺无法一次性发生较长的DNA分子,只能合成众多的短片断。这使得在众多DNA小片断组成的混合物当中,(快)速调取特定数据存在难题。

最后,也是最主要的,DNA储存成本太高了。好比〖现在〗DNA储存200MB数据,需要耗资80万美元,而用电子装备,成本连1美元都不到。

但正如上面所说,若是放到更长的时间尺度上和数据储存空间压力下,DNA具有的大储存密度、高节能环保、超长稳定性的怪异优势就显现出来了。只要随着储存和读取手艺的生长,DNA「编码和测序的」效率提升,成本大幅下降,DNA储存离商业化应用也就不远了。

那么,现在在商业化上有哪些希望呢?

在2015年,微软公司和华盛顿大学互助揭晓了一个功效,接纳定点读取讯息,也就是给一个长长的DNA链里加入一些追踪符号。这些类似索引机制的符号,可以不用每次等测序完整DNA长链,就能选取合适的符号举行读取。

2018年,读取手艺又实现突破,微软研发了「纳米孔」读取手艺,让 DNA 介质列能挤过一个很小的纳米孔而读取其中每个 DNA 碱基。【这一手艺让】大大缩小了读取装备的空间开支,一个手掌巨细的 USB 装备就能举行读取,但读取速率在每秒几KB左右,可以说仍然相当慢。

2019年3月,微软团队在《自然》杂志揭晓一项新的希望,他们开发了世界上第一个自动DNA储存介质。相比较于手动操作举行DNA的合成和测序,能够自动化方式举行DNA编解码才是未来商业化的出路。

另外,关于DNA储存和读取时长以及成本的问题,一家2016年建立的美国初创公司Catalog也正试图实验解决。

去年,Catalog将一共16G的维基百科英文版文本储存在了一个DNA分子上。他们使用了一台DNA书写器装备,以4Mbps的速率在DNA中纪录这些数据。这意味着在一天内可以纪录125GB,约莫相当于高端手机可以储存的容量。这一速率已经是之前研究所储存速率的三倍。

〖现在〗,Catalog使用了由20到30个碱基对长预制合成DNA链,透过酶嵌套在一起,可以储存更多的数据。这些片断的排列就像英语使用26个字母一样,理论上可以创造出无数的组合。据Catalog估量,未来举行1MB数据DNA储存成本将不到0.001美分。

固然,若是未来这家创业公司真的能够将成本大幅降下来,那么确实有可能为DNA数据储存的商业化铺平门路。

在2019年,《科学美国人》与世界经济论坛团结公布的昔时全球十大新兴手艺中, DNA数据储存手艺名列其中。

可以预见,磁储存和光储存方式在未来一段时间仍将占有数据储存方式的主流。不外,纵然我们不会泛起地球末日这种极端情形,由于近几年资料激增,人类也正面临资料储存空间不足的严重问题。同时,资料储存需求激增,带来的是矽晶片使用量的激增,以及由此引发的环境污染问题、水资源和能源消耗等问题。

DNA储存手艺的实现,一定水平将缓解传统储存的容量问题,并大幅削减电子元件和能源的消耗。

固然,在存取手艺上和成本控制上,DNA储存为代表的碳基储存方式另有很长的门路要走,但随着商业化的希望,其规模普及速率也会加(快)。从数据储存的历史来看,储存前言的转变是一个不停转变且加速的历程,DNA储存也应该成为我国关注和研究的手艺偏向。

 加入T客邦telegram送《任天堂Switch大补丸》 ( https://bit.ly/35gy8ig )  

,

sunbet手机版官网下载

欢迎进入sunbet手机版官网下载!Sunbet 申博提供申博开户(sunbet开户)、SunbetAPP下载、Sunbet客户端下载、Sunbet代理合作等业务。

发表评论
请自觉遵守互联网相关的政策法规,严禁发布色情、暴力、反动的言论。
评价:
表情:
用户名: 验证码:点击我更换图片